Cómo extraer texto de su archivo CRAM
- Haga clic en el botón "Seleccionar archivo" de arriba y elija su archivo CRAM.
- Verás una vista previa, si está disponible.
- Haga clic en el botón "Convertir archivo a..." para extraer información de texto.
Convertir CRAM a otro tipo de archivo
Para convertir su archivo CRAM a otro formato, necesita Samtools o otro software Data.
- CRAM a BAM
- CRAM a VCF
- CRAM a CSV
- CRAM a JSON
- CRAM a XML
- CRAM a YAML
- CRAM a YML
- CRAM a TOML
- CRAM a INI
- CRAM a CFG
- CRAM a CONF
- CRAM a DAT
Convertir un archivo a CRAM
Para convertir otros formatos de archivo al tipo de archivo "Bioinformatics & Filesystems", necesita Samtools o software similar.
- DBF a CRAM
- XML a CRAM
- SQLITE a CRAM
- XLSX a CRAM
- SQL a CRAM
- TSV a CRAM
- ACCDB a CRAM
- YAML a CRAM
- MDB a CRAM
- CSV a CRAM
- ODS a CRAM
- JSON a CRAM
Acerca de los archivos CRAM
Los archivos CRAM son un formato altamente eficiente utilizado para almacenar lecturas de secuenciación de ADN comprimidas. Como derivado de BAM, los archivos CRAM son populares en genómica por sus requisitos de almacenamiento reducidos. Sin embargo, la conversión de archivos CRAM a otros formatos es a menudo necesaria para una mayor compatibilidad y análisis.
Los archivos CRAM se pueden convertir a varios formatos, incluyendo BAM, FASTQ y SAM. Las herramientas de software populares para estas conversiones incluyen BCFTools y HTSlib, que ofrecen utilidades de línea de comandos para manejar dichas tareas. Para una comprensión detallada de los archivos CRAM, puede consultar el artículo de Wikipedia sobre CRAM.
Hay consideraciones importantes a tener en cuenta al convertir archivos CRAM. Primero, los archivos CRAM comprimen datos haciendo referencia a genomas de referencia externos, los cuales deben ser accesibles durante la conversión. Esta dependencia puede complicar el proceso de conversión, especialmente cuando se requieren versiones de referencia específicas. Además, el gran tamaño de los datos genómicos puede resultar en largos tiempos de conversión y requerir recursos computacionales significativos.
A pesar de estos desafíos, muchos usuarios encuentran la compresión de CRAM beneficiosa para fines de almacenamiento. Sin embargo, su complejidad puede ser una desventaja, especialmente para aquellos no familiarizados con las herramientas de bioinformática. Por eso, utilizar un servicio fácil de usar como Convert.Guru es ventajoso. Simplemente arrastrando y soltando sus archivos CRAM en nuestra plataforma, puede convertirlos a varios formatos sin la molestia de instalar y aprender software complejo.
Elija Convert.Guru para una experiencia de conversión fluida y eficiente, asegurando que sus datos genómicos estén listos para el análisis en el formato que necesita.
Convert.Guru analiza su archivo CRAM, detecta el formato exacto y le permite leer el texto que contiene.
Los usuarios también convirtieron archivos CRAI, TBI, AVI, PDF, BAM, ZLIB, LAZ y VCF.
Acerca del convertidor CRAM
Convert.Guru se basa en una de las bases de datos de formatos de archivo más grandes y reconocidas, que se mantiene desde hace más de 25 años. Nuestro reconocimiento de formato identifica CRAM de forma fiable — incluso si los archivos tienen un nombre incorrecto o están dañados — y los convierte a formatos comunes. El convertidor CRAM funciona directamente en el navegador, sin registro ni instalación. Los archivos subidos se eliminan automáticamente después de la conversión.