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Convertir SRA a otro tipo de archivo
Para convertir Archivos SRA a otro formato, necesita SRA Toolkit o otro software Datos.
Convertir un archivo a SRA
Para convertir otros formatos de archivo al tipo de archivo "Archivo de datos bioinformáticos", necesita SRA Toolkit o software similar.
Acerca de los archivos SRA
La extensión de archivo .SRA se utiliza principalmente para los archivos de datos de Sequence Read Archive mantenidos por el National Center for Biotechnology Information (NCBI). Estos archivos almacenan datos genéticos sin procesar y altamente comprimidos de secuenciación de próxima generación (NGS). Alternativamente, los archivos .SRA son creados por la HHS Security Risk Assessment Tool para almacenar datos de cumplimiento de HIPAA en el sector salud. Software heredado más antiguo, como Scrapbook Factory de Nova Development, también usa .SRA para archivos de proyectos basados en Microsoft Compound. Finalmente, algunos emuladores de Nintendo 64 como Snes9x lo usan para los datos de guardado de los juegos.
La principal desventaja del formato .SRA del NCBI es su naturaleza altamente especializada y propietaria. Los usuarios no pueden abrir estos archivos en editores de texto estándar porque son archivos binarios comprimidos que a menudo ocupan decenas de gigabytes. Para trabajar con los datos genéticos, los usuarios deben instalar la herramienta de línea de comandos SRA Toolkit. De manera similar, los archivos .SRA de cumplimiento del HHS son bases de datos de Java aisladas que requieren la aplicación de escritorio oficial para leerse, lo que hace que sea frustrante compartirlos con los auditores.
Para casos de uso en bioinformática, los mejores formatos de conversión son los archivos FASTQ o SAM, que se integran a la perfección en los flujos de trabajo de secuenciación estándar. Para la herramienta del HHS, los usuarios deben exportar sus datos a formatos PDF o JSON. Los archivos de guardado de emuladores generalmente no se pueden convertir.
Debido a que los archivos .SRA tienen propósitos completamente distintos dependiendo de su origen, los convertidores en línea estándar no logran procesarlos. Son formatos cerrados que dependen de motores especializados para decodificar los datos internos. Sin embargo, puedes arrastrar y soltar tu archivo en convert.guru para identificar el formato, verlo y convertirlo cuando sea posible. Nuestro sistema inspecciona los encabezados del archivo para determinar si es un archivo genético, una base de datos del HHS o un proyecto de Scrapbook, y puede extraer texto o formatos integrados subyacentes cuando sea compatible.
Convert.Guru analiza su archivo SRA, detecta el formato exacto y le permite leer el texto que contiene.
Si desea convertir un archivo SRA a SRM, SAV, BAM, FASTA, CSV, JSON, XML, YAML, YML, TOML, INI o CFG, puede utilizar SRA Toolkit o un software similar de la categoría "Archivo de datos de secuenciación genética". En el menú Archivo, busque Guardar como… o Exportar….
Para convertir archivos DBF, XML, SQLITE, XLSX, SQL, TSV, ACCDB, YAML, MDB, CSV, ODS o JSON a SRA, pruebe SRA Toolkit u otra herramienta comparable de la categoría "Archivo de datos de secuenciación genética".
Acerca del convertidor SRA
Convert.Guru se basa en una de las bases de datos de formatos de archivo más grandes y reconocidas, que se mantiene desde hace más de 25 años. Nuestro reconocimiento de formato identifica SRA de forma fiable — incluso si los archivos tienen un nombre incorrecto o están dañados — y los convierte a formatos comunes. El convertidor SRA funciona directamente en el navegador, sin registro ni instalación. Los archivos subidos se eliminan automáticamente después de la conversión.