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Convertir SRA en un autre type de fichier
Pour convertir des Archives SRA en un autre format, vous avez besoin de SRA Toolkit ou d'un autre logiciel Données.
Convertir un fichier en SRA
Pour convertir d'autres formats de fichiers au type de fichier "Archive de données bioinformatiques", vous avez besoin de SRA Toolkit ou de logiciel similaire.
À propos des fichiers SRA
L'extension de fichier .SRA est principalement utilisée pour les fichiers de données Sequence Read Archive gérés par le National Center for Biotechnology Information (NCBI). Ces fichiers stockent des données génétiques brutes de séquençage de nouvelle génération (NGS) fortement compressées. Par ailleurs, les fichiers .SRA sont créés par le HHS Security Risk Assessment Tool pour stocker des données de conformité HIPAA dans le domaine de la santé. D'anciens logiciels obsolètes, tels que Scrapbook Factory de Nova Development, utilisent également le .SRA pour les fichiers de projet basés sur Microsoft Compound. Enfin, certains émulateurs Nintendo 64 comme Snes9x l'utilisent pour les données de sauvegarde de jeux.
Le principal inconvénient du format .SRA du NCBI est sa nature hautement spécialisée et propriétaire. Les utilisateurs ne peuvent pas ouvrir ces fichiers dans des éditeurs de texte standard car ce sont des archives binaires compressées qui pèsent souvent des dizaines de gigaoctets. Pour travailler avec les données génétiques, les utilisateurs doivent installer l'outil en ligne de commande SRA Toolkit. De même, les fichiers .SRA de conformité HHS sont des bases de données Java isolées qui nécessitent l'application de bureau officielle pour ètre lues, ce qui les rend frustrants à partager avec les auditeurs.
Pour les cas d'utilisation en bioinformatique, les meilleures cibles de conversion sont les fichiers FASTQ ou SAM, qui s'intègrent parfaitement dans les pipelines de séquençage standard. Pour l'outil HHS, les utilisateurs doivent exporter leurs données aux formats PDF ou JSON. Les fichiers de sauvegarde d'émulateur ne peuvent généralement pas ètre convertis.
Parce que les fichiers .SRA servent des objectifs complètement distincts selon leur origine, les convertisseurs en ligne standard ne parviennent pas à les traiter. Ce sont des formats fermés qui s'appuient sur des moteurs spécialisés pour décoder les données internes. Cependant, tu peux glisser-déposer ton fichier sur convert.guru pour identifier le format, le visualiser et le convertir quand c'est possible. Notre système inspecte les en-têtes de fichiers pour déterminer s'il s'agit d'une archive génétique, d'une base de données HHS ou d'un projet Scrapbook, et peut extraire du texte ou des formats intégrés sous-jacents lorsqu'ils sont pris en charge.
Convert.Guru analyse votre fichier SRA, détecte le format exact et vous permet de lire le texte qu’il contient.
Si vous souhaitez convertir un fichier SRA en SRM, SAV, BAM, FASTA, CSV, JSON, XML, YAML, YML, TOML, INI ou CFG, vous pouvez utiliser SRA Toolkit ou un logiciel similaire de la catégorie « Archive de données de séquençage génétique ». Dans le menu Fichier, recherchez Enregistrer sous… ou Exporter….
Pour convertir des fichiers DBF, XML, SQLITE, XLSX, SQL, TSV, ACCDB, YAML, MDB, CSV, ODS ou JSON en SRA, essayez SRA Toolkit ou un autre outil comparable dans la catégorie « Archive de données de séquençage génétique ».
Le convertisseur SRA
Convert.Guru s’appuie sur l’une des bases de données de formats de fichiers les plus vastes et les plus réputées, entretenue depuis plus de 25 ans. Notre détection de format identifie SRA de manière fiable — même lorsque les fichiers sont mal nommés ou endommagés — et les convertit vers des formats courants. Directement dans le navigateur, sans inscription ni installation. Les fichiers téléversés sont automatiquement supprimés après la conversion. Le convertisseur SRA est développé en Europe.