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Convertir FASTA a otro tipo de archivo
Para convertir secuencias FASTA a otro formato, necesita NCBI BLAST o otro software Datos.
Convertir un archivo a FASTA
Para convertir otros formatos de archivo al tipo de archivo "Formato de secuencia bioinformática", necesita NCBI BLAST o software similar.
Acerca de los archivos FASTA
El formato de archivo .FASTA es un formato estandarizado basado en texto utilizado en bioinformática para almacenar secuencias de nucleótidos (ADN/ARN) o péptidos (aminoácidos). Desarrollado en 1985 por David J. Lipman y William R. Pearson, representa secuencias utilizando códigos de una sola letra. Cada entrada comienza con una descripción de una sola línea marcada por un símbolo de mayor que (>), seguida de líneas de datos de secuencia. Es leído de forma nativa por software de análisis de secuencias como NCBI BLAST, BioEdit y Clustal Omega. Puedes leer más sobre sus especificaciones técnicas en Wikipedia.
A pesar de ser el estándar de facto en genómica, el formato .FASTA tiene claras desventajas. Al ser puramente texto sin formato, carece por completo de la estructura necesaria para contener anotaciones biológicas complejas, características genómicas o metadatos enriquecidos. Además, debido a que el formato simplemente envuelve largas cadenas de caracteres en múltiples líneas bajo una sola línea de encabezado, es notoriamente difícil de analizar en software de oficina estándar. Los sistemas operativos no reconocen la extensión del archivo por defecto, y abrirlo en un software de hojas de cálculo da como resultado datos desordenados e ilegibles.
Para superar estas limitaciones, a menudo es necesario convertir el archivo. Para el análisis de datos tabulares en R, Python o aplicaciones de hojas de cálculo, convierte tu .FASTA a CSV o TSV. Si necesitas anotaciones biológicas enriquecidas junto con la secuencia sin procesar, elige los formatos GFF o GB (GenBank). Para compartirlo de forma sencilla y legible para humanos sin necesidad de software especializado, conviértelo a TXT. Solo arrastra y suelta tu archivo aquí para analizarlo y convertirlo: gratis, en línea y sin instalar paquetes bioinformáticos complejos.
Convert.Guru analiza su archivo FASTA, detecta el formato exacto y le permite leer el texto que contiene.
Si desea convertir un archivo FASTA a CSV, TXT, GENBANK, BAM, JSON, VCF, XML, YAML, YML, TOML, INI o CFG, puede utilizar NCBI BLAST o un software similar de la categoría "Almacenamiento de datos de secuencias biológicas". En el menú Archivo, busque Guardar como… o Exportar….
Para convertir archivos DBF, XML, SQLITE, XLSX, SQL, TSV, ACCDB, YAML, MDB, CSV, ODS o JSON a FASTA, pruebe NCBI BLAST u otra herramienta comparable de la categoría "Almacenamiento de datos de secuencias biológicas".
Acerca del convertidor FASTA
Convert.Guru se basa en una de las bases de datos de formatos de archivo más grandes y reconocidas, que se mantiene desde hace más de 25 años. Nuestro reconocimiento de formato identifica FASTA de forma fiable — incluso si los archivos tienen un nombre incorrecto o están dañados — y los convierte a formatos comunes. El convertidor FASTA funciona directamente en el navegador, sin registro ni instalación. Los archivos subidos se eliminan automáticamente después de la conversión.