SRAコンバーターについて
Convert.Guru は、25年以上にわたり維持・更新されてきた、世界最大級かつ信頼性の高いファイル形式データベースの一つを基盤としています。 当社の形式判定機能は、SRA を高い精度で識別します。ファイル名が誤っている場合や破損している場合でも対応し、一般的な形式へ変換できます。SRA コンバーターは登録やインストール不要で、ブラウザ上でそのまま利用できます。 アップロードされたファイルは、変換後に自動的に削除されます。
SRA コンバーター
アーカイブまたは評価ファイル (SRA) からテキストを抽出
SRA ファイルからテキストを抽出する方法
- 上記の "ファイルを選択" ボタンをクリックし、SRA ファイルを選択します。
- 利用可能な場合は、プレビューが表示されます。
- "ファイルを変換..." ボタンをクリックして、テキスト情報を抽出します。
SRA ファイルについて
.SRAファイル拡張子は、主にNational Center for Biotechnology Information (NCBI)が管理するSequence Read Archiveデータファイルに使用される。これらのファイルには、高度に圧縮された生の次世代シーケンシング（NGS）遺伝子データが保存されている。また、.SRAファイルは、医療分野のHIPAAコンプライアンスデータを保存するためにHHS Security Risk Assessment Toolによって作成されることもある。Nova DevelopmentのScrapbook Factoryのような古いレガシーソフトウェアも、Microsoft Compoundベースのプロジェクトファイルに.SRAを使用している。さらに、Snes9xなどの一部のNintendo 64エミュレーターでは、ゲームのセーブデータとして使用されている。
NCBIの.SRAフォーマットの主な欠点は、その高度に専門化された独自の性質にある。数十ギガバイトに及ぶ圧縮されたバイナリアーカイブであるため、標準的なテキストエディタで開くことはできない。遺伝子データを扱うには、コマンドラインのSRA Toolkitをインストールする必要がある。同様に、HHSコンプライアンスの.SRAファイルは独立したJavaデータベースであり、読み取るには公式のデスクトップアプリが必要なため、監査人と共有する際に不便である。
バイオインフォマティクスの用途では、標準的なシーケンシングパイプラインにシームレスに統合できる.FASTQまたは.SAMファイルへの変換が最適だ。HHSツールの場合は、データを.PDFまたは.JSONフォーマットにエクスポートする必要がある。エミュレーターのセーブファイルは、通常変換できない。
.SRAファイルは作成元によって全く異なる目的を持つため、標準的なオンラインコンバーターでは処理できない。これらは内部データをデコードするために専用のエンジンに依存するクローズドなフォーマットだ。しかし、ファイルをconvert.guruにドラッグ＆ドロップすれば、フォーマットを特定し、内容を表示して、可能な場合は変換することができる。当社のシステムはファイルヘッダーを検査して、それが遺伝子アーカイブ、HHSデータベース、またはScrapbookプロジェクトのいずれであるかを判断し、サポートされている場合はテキストや埋め込まれた基盤フォーマットを抽出できる。
Convert.Guru はSRAファイルを分析し、正確な形式を検出して、中のテキストを読めるようにします。
ほかのユーザーは SRM, N64, ZIP, SAM, FMS, MOC, SAV, BAM, FASTA ファイルも変換しました。
よくある質問
SRA ファイルを SRM, SAV, BAM, FASTA, CSV, JSON, XML, YAML, YML, TOML, INI または CFG に変換したい場合は、SRA Toolkit または「遺伝子シーケンシングデータアーカイブ」カテゴリの同様のソフトウェアを使用できます。[ファイル] メニューで 名前を付けて保存… または エクスポート… を探してください。
DBF, XML, SQLITE, XLSX, SQL, TSV, ACCDB, YAML, MDB, CSV, ODS または JSON ファイルを SRA に変換するには、SRA Toolkit または「遺伝子シーケンシングデータアーカイブ」カテゴリの他の同等のツールを試してください。