유전체 접촉 행렬 (HIC)에서 텍스트 추출
.HIC 파일은 Hi-C 시퀀싱으로 생성된 염색체 접촉 지도를 저장하는 데 사용되는 고도로 압축된 생물학적 데이터 형식입니다. 이 파일들은 3D 게놈 구조를 시각화하기 위한 주요 저장 메커니즘 역할을 합니다. 이 파일들을 열고 상호작용하는 데 사용되는 주요 소프트웨어는 Aiden Lab에서 개발한 Juicebox와 관련 명령줄 유틸리티인 Juicer Tools입니다.
사용자들은 .HIC 파일을 다룰 때 종종 큰 어려움에 직면합니다. 여러 해상도에 걸쳐 수백만 개의 쌍별 게놈 상호작용을 저장하기 때문에, 이 파일들의 크기는 일상적으로 수 기가바이트를 초과합니다. 이는 표준 소프트웨어로는 전혀 읽을 수 없는 독점적인 폐쇄형 바이너리 형식입니다. 표준 텍스트 편집기나 스프레드시트 애플리케이션에서 .HIC 파일을 열려고 시도하면 시스템이 즉시 다운될 것입니다. 또한, 웹 브라우저나 일반적인 데이터 시각화 도구에서는 이 파일들을 기본적으로 볼 수 없습니다.
Python이나 R에서 맞춤형 생물정보학 분석을 수행하려면, 사용자들은 일반적으로 포함된 데이터를 TXT, CSV 또는 .BEDPE와 같은 플랫 형식으로 변환하거나 추출해야 합니다. 주의하세요: 고도로 압축된 .HIC 파일을 원시 텍스트 행렬로 추출하면 파일 크기가 엄청나게 커지고 형식의 빠른 확대/축소 인덱싱 구조가 완전히 손실됩니다.
극단적인 특수성 때문에 표준 온라인 파일 변환기는 .HIC 파일을 처리하지 못합니다. 종종 원본 생물정보학 소프트웨어만이 다중 해상도 2D 게놈 데이터를 제대로 읽거나 내보낼 수 있습니다. 하지만 convert.guru는 여전히 파일 형식을 식별하고, 파일을 검사하며, 텍스트나 내부 콘텐츠를 보여줄 수 있습니다. 우리의 분석은 많은 .HIC 파일 내에 포함된 기본 ZIP 기반 압축 구조를 감지하기 때문에, 원시 메타데이터를 보거나 부분적인 추출이 여전히 가능할 수 있습니다. 파일을 드래그 앤 드롭하여 파일의 정체를 확인하고, 지원되는 경우 변환해 보세요.
Convert.Guru는 HIC 파일을 분석하고 정확한 형식을 감지한 다음, 내부의 텍스트를 읽을 수 있게 해줍니다.
사용자들은 HEIC, GPX, PHO 및 QZTP 파일도 변환했습니다.
HIC 파일을 (으)로 변환하려면 Juicebox 또는 "게놈 접촉 데이터 저장" 카테고리의 유사한 소프트웨어를 사용할 수 있습니다. 파일 메뉴에서 다른 이름으로 저장… 또는 내보내기… 메뉴를 확인해 보세요.
파일을 HIC(으)로 변환하려면 Juicebox 또는 "게놈 접촉 데이터 저장" 카테고리의 다른 유사한 도구를 사용해 보세요.
Convert.Guru는 25년 이상 지속적으로 유지·관리되어 온, 세계 최대 규모이자 가장 신뢰받는 파일 형식 데이터베이스 중 하나를 기반으로 합니다. Convert.Guru의 형식 감지 기능은 파일명이 잘못 지정되었거나 파일이 손상된 경우에도 HIC를 정확하게 식별하고, 널리 사용되는 형식으로 변환합니다. HIC 변환기는 브라우저에서 바로 사용할 수 있으며, 회원가입이나 설치가 필요 없습니다. 업로드된 파일은 변환이 완료되면 자동으로 삭제됩니다.