Haga clic en el botón "Seleccionar archivo" de arriba y elija su archivo HIC.
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Convertir HIC a otro tipo de archivo
Para convertir matrices de contacto HIC a otro formato, necesita Juicebox o otro software Datos.
Convertir un archivo a HIC
Para convertir otros formatos de archivo al tipo de archivo "Matriz de contacto genómico", necesita Juicebox o software similar.
Acerca de los archivos HIC
El archivo .HIC es un formato de datos biológicos altamente comprimido que se utiliza para almacenar mapas de contacto cromosómico generados por la secuenciación Hi-C. Estos archivos sirven como el mecanismo de almacenamiento principal para visualizar la arquitectura del genoma en 3D. El software principal utilizado para abrir e interactuar con estos archivos es Juicebox y su utilidad de línea de comandos asociada, Juicer Tools, ambos desarrollados por Aiden Lab.
Los usuarios a menudo se enfrentan a enormes desafíos al manejar archivos .HIC. Debido a que almacenan millones de interacciones genómicas por pares en múltiples resoluciones, estos archivos superan habitualmente varios gigabytes de tamaño. Es un formato binario cerrado y propietario que es completamente ilegible para el software estándar. Intentar abrir un archivo .HIC en editores de texto estándar o aplicaciones de hojas de cálculo bloqueará instantáneamente tu sistema. Además, no puedes ver estos archivos de forma nativa en navegadores web o herramientas genéricas de visualización de datos.
Para realizar análisis bioinformáticos personalizados en Python o R, los usuarios generalmente necesitan convertir o extraer los datos incrustados en formatos planos como TXT, CSV o .BEDPE. Ten cuidado: extraer un archivo .HIC altamente comprimido en una matriz de texto sin formato resultará en tamaños de archivo masivos y la pérdida completa de la estructura de indexación de zoom rápido del formato.
Debido a su extrema especialización, los convertidores de archivos en línea estándar no podrán procesar un archivo .HIC. A menudo, solo el software bioinformático original puede leer o exportar correctamente los datos genómicos 2D de múltiples resoluciones. Sin embargo, convert.guru aún puede identificar el formato del archivo, inspeccionarlo y mostrar texto o contenido interno. Debido a que nuestro análisis detecta la estructura de compresión basada en ZIP subyacente incrustada dentro de muchos archivos .HIC, es posible que aún sea posible ver metadatos sin procesar o realizar una extracción parcial. Simplemente arrastra y suelta tu archivo para ver qué es y conviértelo si es compatible.
Convert.Guru analiza su archivo HIC, detecta el formato exacto y le permite leer el texto que contiene.
Los usuarios también convirtieron archivos HEIC, GPX, PHO y QZTP.
Preguntas frecuentes
Si desea convertir un archivo HIC a , puede utilizar Juicebox o un software similar de la categoría "Almacenamiento de datos de contacto genómico". En el menú Archivo, busque Guardar como… o Exportar….
Para convertir archivos a HIC, pruebe Juicebox u otra herramienta comparable de la categoría "Almacenamiento de datos de contacto genómico".
Acerca del convertidor HIC
Convert.Guru se basa en una de las bases de datos de formatos de archivo más grandes y reconocidas, que se mantiene desde hace más de 25 años. Nuestro reconocimiento de formato identifica HIC de forma fiable — incluso si los archivos tienen un nombre incorrecto o están dañados — y los convierte a formatos comunes. El convertidor HIC funciona directamente en el navegador, sin registro ni instalación. Los archivos subidos se eliminan automáticamente después de la conversión.