FASTAコンバーターについて
Convert.Guru は、25年以上にわたり維持・更新されてきた、世界最大級かつ信頼性の高いファイル形式データベースの一つを基盤としています。 当社の形式判定機能は、FASTA を高い精度で識別します。ファイル名が誤っている場合や破損している場合でも対応し、一般的な形式へ変換できます。FASTA コンバーターは登録やインストール不要で、ブラウザ上でそのまま利用できます。 アップロードされたファイルは、変換後に自動的に削除されます。
FASTA コンバーター
DNA・タンパク質配列 (FASTA) からテキストを抽出
FASTA ファイルからテキストを抽出する方法
- 上記の "ファイルを選択" ボタンをクリックし、FASTA ファイルを選択します。
- 利用可能な場合は、プレビューが表示されます。
- "ファイルを変換..." ボタンをクリックして、テキスト情報を抽出します。
FASTA を別のファイルタイプに変換
FASTA 配列 を別の形式に変換する、Data ファイル形式専用のデスクトップソフトウェアが必要です。
ファイルを FASTA に変換
他のファイル形式を FASTA 形式に変換するには、Data ファイル形式専用のデスクトップソフトウェアが必要です。
FASTA ファイルについて
.FASTAファイル形式は、バイオインフォマティクスにおいてヌクレオチド（DNA/RNA）やペプチド（アミノ酸）の配列を保存するために使用される、標準化されたテキストベースのフォーマットだ。1985年にDavid J. LipmanとWilliam R. Pearsonによって開発され、1文字のコードを使って配列を表現する。各エントリは、大なり記号（>）で始まる1行の説明から始まり、その後に配列データの行が続く。NCBI BLAST、BioEdit、Clustal Omegaなどの配列解析ソフトウェアでネイティブに読み込むことができる。技術的な仕様の詳細はWikipediaで確認できる。
ゲノミクスにおける事実上の標準であるにもかかわらず、.FASTA形式には明確な欠点がある。純粋なプレーンテキストであるため、複雑な生物学的アノテーション、ゲノムの特徴、またはリッチなメタデータを保持するために必要な構造が完全に欠けている。さらに、単一のヘッダー行の下に長い文字列を複数行にわたって折り返しているだけなので、標準的なオフィスソフトウェアで解析するのは非常に困難だ。オペレーティングシステムはデフォルトでこのファイル拡張子を認識せず、表計算ソフトウェアで開くと、データが乱れて読めなくなってしまう。
これらの制限を克服するためには、ファイルの変換が必要になることが多い。R、Python、または表計算アプリケーションで表形式のデータ分析を行う場合は、.FASTAを.CSVまたは.TSVに変換しよう。生の配列と一緒にリッチな生物学的アノテーションが必要な場合は、.GFFまたは.GB（GenBank）形式をターゲットにするといい。専用のソフトウェアを必要とせず、人間が読める形式で簡単に共有したい場合は、.TXTに変換しよう。ファイルをここにドラッグ＆ドロップするだけで、複雑なバイオインフォマティクスパッケージをインストールすることなく、オンラインで無料で解析・変換できる。
Convert.Guru はFASTAファイルを分析し、正確な形式を検出して、中のテキストを読めるようにします。
ほかのユーザーは FA, FAS, FSTA, FASTQ, FNA, TXT, GZ, AB1, ZIP, FAA, STATISTICS, PDF, CSV ファイルも変換しました。
よくある質問
FASTA ファイルを CSV, TXT, GENBANK, BAM, JSON, VCF, XML, YAML, YML, TOML, INI または CFG に変換したい場合は、Data ファイル形式専用のデスクトップソフトウェアを使用できます。[ファイル] メニューで 名前を付けて保存… または エクスポート… を探してください。
DBF, XML, SQLITE, XLSX, SQL, TSV, ACCDB, YAML, MDB, CSV, ODS または JSON ファイルを FASTA に変換するには、Data ファイル形式専用のデスクトップソフトウェアを試してください。