AB1 コンバーター

DNAクロマトグラム (AB1) からテキストを抽出


.AB1 ファイルをドロップまたはアップロード

AB1 ファイルからテキストを抽出する方法

  1. 上記の "ファイルを選択" ボタンをクリックし、AB1 ファイルを選択します。
  2. 利用可能な場合は、プレビューが表示されます。
  3. "ファイルを変換..." ボタンをクリックして、テキスト情報を抽出します。

AB1 を別のファイルタイプに変換

AB1 クロマトグラム を別の形式に変換する、Sequence Scanner または データ ソフトウェアが必要です。

ファイルを AB1 に変換

他のファイル形式を "バイオインフォマティクス トレースファイル" ファイル形式に変換するには、Sequence Scanner または類似のソフトウェアが必要です。


AB1 ファイルについて

AB1ファイルは、主にApplied Biosystems社製のサンガーシーケンス機器によって作成されるDNAシーケンスクロマトグラムファイルだよ。これには、生の蛍光強度データ(エレクトロフェログラムトレース)と、シーケンサーの実行によるベースコールの両方が含まれているんだ。通常、これらのファイルはSnapGeneやChromasのような専用のバイオインフォマティクスツールを使って表示されるよ。

でも、.AB1フォーマットはプロプライエタリ(独自仕様)で、完全にバイナリ形式なんだ。その内部構造はバラバラなことで有名で、新しいシーケンサーモデルがリリースされるたびに新しいフィールドが単に追加されるという形で、何十年にもわたって無計画に進化してきたんだ。標準的なテキストエディタで開いて遺伝子配列を見ることはできないから、同僚と共有したり、基本的なアライメントパイプラインに入力したりする時にイライラすることがあるよね。

ダウンストリーム解析でDNAシーケンスデータを実際に使うには、変換が必要だよ。シーケンスをFASTAFASTQファイルに抽出すると、生のバイナリデータがBLAST検索やシーケンスアセンブリに広く受け入れられているテキストベースのフォーマットに変換されるんだ。技術者以外の関係者と視覚的なピークトレースを共有する必要がある場合は、PDFに変換することで静的なグラフィックスナップショットを作成できるよ。ブラウザ上で安全に表示・変換するには、ここにファイルをドロップしてね。

Convert.Guru はAB1ファイルを分析し、正確な形式を検出して、中のテキストを読めるようにします。

ほかのユーザーは ABI, AB, FSTA, SEQ, FASTA, ZIP, FAS, SCF, PDF, TXT, RAR, GB, DOCX ファイルも変換しました。


よくある質問

AB1 ファイルを FASTA, PDF, CSV, JSON, XML, YAML, YML, TOML, INI, CFG, CONF または DAT に変換したい場合は、Sequence Scanner または「DNAシーケンスクロマトグラムの保存」カテゴリの同様のソフトウェアを使用できます。[ファイル] メニューで 名前を付けて保存… または エクスポート… を探してください。

DBF, XML, SQLITE, XLSX, SQL, TSV, ACCDB, YAML, MDB, CSV, ODS または JSON ファイルを AB1 に変換するには、Sequence Scanner または「DNAシーケンスクロマトグラムの保存」カテゴリの他の同等のツールを試してください。



AB1コンバーターについて

Convert.Guru は、25年以上にわたり維持・更新されてきた、世界最大級かつ信頼性の高いファイル形式データベースの一つを基盤としています。 当社の形式判定機能は、AB1 を高い精度で識別します。ファイル名が誤っている場合や破損している場合でも対応し、一般的な形式へ変換できます。AB1 コンバーターは登録やインストール不要で、ブラウザ上でそのまま利用できます。 アップロードされたファイルは、変換後に自動的に削除されます。