FNA コンバーター

FASTA配列ファイル (FNA) からテキストを抽出


.FNA ファイルをドロップまたはアップロード

FNA ファイルからテキストを抽出する方法

  1. 上記の "ファイルを選択" ボタンをクリックし、FNA ファイルを選択します。
  2. 利用可能な場合は、プレビューが表示されます。
  3. "ファイルを変換..." ボタンをクリックして、テキスト情報を抽出します。

FNA を別のファイルタイプに変換

FNA 配列ファイル を別の形式に変換する、NCBI BLAST または データ ソフトウェアが必要です。

ファイルを FNA に変換

他のファイル形式を "バイオインフォマティクス配列ファイル" ファイル形式に変換するには、NCBI BLAST または類似のソフトウェアが必要です。


FNA ファイルについて

.FNAファイル形式は、核酸配列(DNAまたはRNA)を保存するためにバイオインフォマティクスで広く使用されている標準的なテキストベースのファイルだ。元々はFASTAソフトウェアパッケージ用に開発され、ヌクレオチドを表すために1文字のコード(A、C、G、Tなど)を使用する。各配列は、大なり記号(>)で始まる1行の説明から始まり、その後に生の配列データの行が続く。

これらのファイルは、NCBI BLAST、Bowtie、SAMtoolsなどのゲノム解析ツールで広く受け入れられており、NCBI GenBankなどのデータベースから頻繁にダウンロードされる。

単純なプレーンテキストであるにもかかわらず、.FNAファイルには特有の課題がある。全ゲノム配列は簡単に数ギガバイトを超えることがあり、Microsoft WordやNotepadなどの標準的なテキストエディタを即座にクラッシュさせてしまう。さらに、この形式には単一のヘッダー行以外の構造化されたメタデータがないため、データベース間でヘッダーの形式が一致していない場合、プログラムによるデータ抽出が面倒になる。特定の解析パイプラインにおける拡張子の制限を回避したり、ヘッダーデータを表形式に抽出したりするために、ユーザーはしばしばこれらのファイルを変換する必要がある。

テキストとして簡単に表示するには、ファイルを.TXTに変換しよう。配列IDをアノテーションにマッピングする必要がある場合は、ヘッダーを.CSVスプレッドシートに変換するとよい。古いバイオインフォマティクスソフトウェアとの互換性を確保するには、名前を変更するか、.FASTAまたは.FAに変換しよう。小さな遺伝子断片を公開または共有する場合は、.PDFに変換する。ここにファイルをドロップすれば、ブラウザ上で安全に解析・変換できる。無料でオンラインで利用でき、ソフトウェアのインストールも不要だ。

Convert.Guru はFNAファイルを分析し、正確な形式を検出して、中のテキストを読めるようにします。

ほかのユーザーは FASTA, FAA, ZIP, GZ, GTF, GFF, GBK, JSONL, FA, ND2, DOCX, TXT, TSX ファイルも変換しました。


よくある質問

FNA ファイルを FASTA に変換したい場合は、NCBI BLAST または「核酸配列の保存」カテゴリの同様のソフトウェアを使用できます。[ファイル] メニューで 名前を付けて保存… または エクスポート… を探してください。

ファイルを FNA に変換するには、NCBI BLAST または「核酸配列の保存」カテゴリの他の同等のツールを試してください。



FNAコンバーターについて

Convert.Guru は、25年以上にわたり維持・更新されてきた、世界最大級かつ信頼性の高いファイル形式データベースの一つを基盤としています。 当社の形式判定機能は、FNA を高い精度で識別します。ファイル名が誤っている場合や破損している場合でも対応し、一般的な形式へ変換できます。FNA コンバーターは登録やインストール不要で、ブラウザ上でそのまま利用できます。 アップロードされたファイルは、変換後に自動的に削除されます。