변이 주석 파일 (MAF)에서 텍스트 추출
.MAF 파일은 주로 Mutation Annotation Format 파일이야. The Cancer Genome Atlas (TCGA)에서 개발했으며, DNA 시퀀싱 중 발견된 단일 염기 다형성(SNP) 및 작은 삽입 또는 결실(INDEL)과 같은 집계된 체세포 돌연변이 데이터를 저장해. 기본적으로 엄격하게 구조화된 탭으로 구분된 텍스트 파일이기 때문에, 생물정보학 연구자들은 이 데이터 세트를 처리하기 위해 GDC Data Portal이나 R 패키지 maftools 같은 도구에 의존해. 또는 .MAF는 Microsoft Access Form Shortcut(UTF-16 LE로 인코딩됨)으로 기능하여 Windows 사용자가 Access 데이터베이스 내에서 특정 양식을 빠르게 실행할 수 있게 해줘. 드물게는 UCSC Genome Browser에서 다중 서열 정렬 파일로 사용되거나 Capcom MT Framework 엔진의 독점 3D 게임 캐릭터 애니메이션 파일로도 사용돼.
.MAF 파일을 직접 다루는 것은 매우 어려워. 게놈 .MAF 파일은 종종 100MB와 수백만 행을 초과할 정도로 거대해서, 일반적인 텍스트 편집기로 열면 멈추거나 충돌하기 십상이야. 또한 120개 이상의 필수 열을 구문 분석하려면 전문적인 생물정보학 지식이 필요해. 한편, Microsoft Access 바로 가기는 철저히 독점적이며, 로컬에서 정확히 일치하는 데이터베이스 파일이 없으면 완전히 무용지물이고, 최신 웹 브라우저나 Windows 이외의 운영 체제에서는 지원되지 않아. 게임 애니메이션 파일은 완전히 잠겨 있으며 Blender나 Maya 같은 표준 3D 모델링 제품군에서는 기본 지원이 부족해.
일반 데이터 분석가가 생물정보학 돌연변이 데이터를 읽을 수 있게 하려면, 스크립팅을 더 쉽게 하기 위해 .MAF를 CSV 또는 TSV로 변환하거나, 데이터 세트가 Microsoft Excel의 1,048,576행 제한 미만인 경우 XLSX로 변환해. 간단한 프로그래밍 방식의 구문 분석을 위해서는 파일을 기본 TXT 또는 JSON으로 변환하는 것을 강력히 권장해. 소프트웨어를 설치할 필요 없이 무료로 온라인에서 파일을 분석하고 변환하려면 여기에 파일을 끌어다 놓기만 하면 돼.
Convert.Guru는 MAF 파일을 분석하고 정확한 형식을 감지한 다음, 내부의 텍스트를 읽을 수 있게 해줍니다.
사용자들은 MAF 2, GZ, BIB, PDF, LDB, ACCDB, MAG, VCF, BCM, MCM, FASTA, MAP 및 PAF 파일도 변환했습니다.
MAF 파일을 VCF, BCM, MCM, FASTA, MAP, PAF, EAF, DB, SQLITE, SQLITE3, MDB 또는 ACCDB(으)로 변환하려면 maftools 또는 "게놈 돌연변이 데이터 저장" 카테고리의 유사한 소프트웨어를 사용할 수 있습니다. 파일 메뉴에서 다른 이름으로 저장… 또는 내보내기… 메뉴를 확인해 보세요.
NDF, SQLITE3, BAK, RDB, SQL, DB4, MDF, MDB, LDF, DB, DB3 또는 SQLITE 파일을 MAF(으)로 변환하려면 maftools 또는 "게놈 돌연변이 데이터 저장" 카테고리의 다른 유사한 도구를 사용해 보세요.
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