MAFコンバーターについて
Convert.Guru は、25年以上にわたり維持・更新されてきた、世界最大級かつ信頼性の高いファイル形式データベースの一つを基盤としています。 当社の形式判定機能は、MAF を高い精度で識別します。ファイル名が誤っている場合や破損している場合でも対応し、一般的な形式へ変換できます。MAF コンバーターは登録やインストール不要で、ブラウザ上でそのまま利用できます。 アップロードされたファイルは、変換後に自動的に削除されます。
MAF コンバーター
変異アノテーションファイル (MAF) からテキストを抽出
MAF ファイルからテキストを抽出する方法
- 上記の "ファイルを選択" ボタンをクリックし、MAF ファイルを選択します。
- 利用可能な場合は、プレビューが表示されます。
- "ファイルを変換..." ボタンをクリックして、テキスト情報を抽出します。
MAF ファイルについて
.MAFファイルは、主にMutation Annotation Formatファイルだよ。The Cancer Genome Atlas (TCGA)によって開発され、DNAシーケンシング中に発見された一塩基多型（SNPs）や小さな挿入・欠失（INDELs）などの集約された体細胞突然変異データを保存しているんだ。基本的には厳密に構造化されたタブ区切りのテキストファイルだから、バイオインフォマティクスの研究者はこれらのデータセットを処理するために、GDC Data PortalやRパッケージのmaftoolsのようなツールに頼っているよ。また、.MAFはMicrosoft Access Form Shortcut（UTF-16 LEエンコード）としても機能し、WindowsユーザーがAccessデータベース内の特定のフォームをすばやく起動できるようにもなるんだ。まれなケースとして、UCSC Genome Browserのマルチプルアライメントファイルや、Capcom MT Frameworkエンジンの独自の3Dゲームキャラクターアニメーションファイルとして使われることもあるよ。
.MAFファイルを直接扱うのはかなり大変なんだ。ゲノムの.MAFファイルは非常に巨大で、100MBや数百万行を超えることもよくあるから、標準的なテキストエディタで開くとフリーズしたりクラッシュしたりしてしまうよ。さらに、120以上の必須カラムを解析するには、バイオインフォマティクスの専門知識が必要になるんだ。一方、Microsoft Accessのショートカットは完全に独自仕様で、対応するデータベースファイルがローカルにないと全く役に立たないし、最新のウェブブラウザやWindows以外のOSではサポートされていないよ。ゲームのアニメーションファイルは完全にロックされていて、BlenderやMayaのような標準的な3Dモデリングソフトではネイティブサポートされていないんだ。
バイオインフォマティクスの変異データを一般的なデータアナリストが読みやすくするには、スクリプト処理しやすいように.MAFをCSVやTSVに変換するか、データセットがMicrosoft Excelの1,048,576行の制限内に収まるならXLSXに変換するのがおすすめだよ。プログラムでシンプルに解析したいなら、基本的なTXTやJSONに変換するのが強く推奨されるよ。ここにファイルをドラッグ＆ドロップするだけで、無料でオンラインのまま、ソフトウェアをインストールせずに解析・変換できるよ。
Convert.Guru はMAFファイルを分析し、正確な形式を検出して、中のテキストを読めるようにします。
ほかのユーザーは MAF 2, GZ, BIB, PDF, LDB, ACCDB, MAG, VCF, BCM, MCM, FASTA, MAP, PAF ファイルも変換しました。
よくある質問
MAF ファイルを VCF, BCM, MCM, FASTA, MAP, PAF, EAF, DB, SQLITE, SQLITE3, MDB または ACCDB に変換したい場合は、maftools または「ゲノム変異データの保存」カテゴリの同様のソフトウェアを使用できます。[ファイル] メニューで 名前を付けて保存… または エクスポート… を探してください。
NDF, SQLITE3, BAK, RDB, SQL, DB4, MDF, MDB, LDF, DB, DB3 または SQLITE ファイルを MAF に変換するには、maftools または「ゲノム変異データの保存」カテゴリの他の同等のツールを試してください。