BLASTコンバーターについて
Convert.Guru は、25年以上にわたり維持・更新されてきた、世界最大級かつ信頼性の高いファイル形式データベースの一つを基盤としています。 当社の形式判定機能は、BLAST を高い精度で識別します。ファイル名が誤っている場合や破損している場合でも対応し、一般的な形式へ変換できます。BLAST コンバーターは登録やインストール不要で、ブラウザ上でそのまま利用できます。 アップロードされたファイルは、変換後に自動的に削除されます。
BLAST コンバーター
配列アライメント (BLAST) からテキストを抽出
BLAST ファイルからテキストを抽出する方法
- 上記の "ファイルを選択" ボタンをクリックし、BLAST ファイルを選択します。
- 利用可能な場合は、プレビューが表示されます。
- "ファイルを変換..." ボタンをクリックして、テキスト情報を抽出します。
BLAST ファイルについて
.BLASTファイル拡張子には、NCBI BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）アルゴリズムによって生成されたシーケンスアライメント検索結果が含まれている。これらのファイルは、クエリされたヌクレオチドまたはタンパク質のシーケンスを膨大な生物学データベースとマッピングし、局所的な類似性を持つ領域を見つけるための重要なバイオインフォマティクスデータを保存している。
標準的なオンラインコンバーターは、.BLASTファイルの処理に失敗することが多い。エクスポートのパラメータによって、ファイルには生のプレーンテキスト、ペアワイズアライメント、または構造化されたXMLデータが含まれる。このフォーマットの主な欠点は、その高度に専門化された性質にある。大規模なゲノムクエリの場合、ファイルサイズが100MBを超えることも多く、表形式のデータを抽出したりアライメントを視覚化したりするには、UGENEのような専用のバイオインフォマティクスソフトウェアや、BioPythonによるプログラム的な解析が必要になる。生の.BLAST出力を非技術的な関係者と共有したり、標準的なオフィスソフトウェアで開こうとしたりすると、通常はフォーマットが崩れた読めないテキストの壁になってしまう。
このデータを学術的なパイプラインの外で役立てるため、研究者はヒットテーブルをスプレッドシートにインポートできるように、.BLASTを.CSV、.XML、または.TXTに変換する必要に迫られることが多い。視覚化されたデータは、.PDFや.PNGにエクスポートされるのが一般的だ。
これはニッチなデータフォーマットであるため、元のバイオインフォマティクス環境なしで開いたり変換したりするのは難しい。ファイルをconvert.guruにドラッグ＆ドロップするだけで、フォーマットを識別し、内部コンテンツを検査して、可能な場合は変換できる。サポートされている基盤となるプレーンテキストや表形式データをシステムが検出した場合、表示や抽出は高速かつ安全に行われる。
Convert.Guru はBLASTファイルを分析し、正確な形式を検出して、中のテキストを読めるようにします。
ほかのユーザーは DICTIONARY, DEAD, EXE2 ファイルも変換しました。
よくある質問
BLAST ファイルを CSV, JSON, XML, YAML, YML, TOML, INI, CFG, CONF, DAT, DB または SQL に変換したい場合は、NCBI BLAST または「シーケンスアライメント検索結果」カテゴリの同様のソフトウェアを使用できます。[ファイル] メニューで 名前を付けて保存… または エクスポート… を探してください。
DBF, XML, SQLITE, XLSX, SQL, TSV, ACCDB, YAML, MDB, CSV, ODS または JSON ファイルを BLAST に変換するには、NCBI BLAST または「シーケンスアライメント検索結果」カテゴリの他の同等のツールを試してください。