Text aus DNA-Chromatogramme (AB1) auslesen
Um AB1 Chromatogramme in ein anderes Format umzuwandeln, benötigen Sie Sequence Scanner oder eine andere Daten-Software.
Um andere Dateiformate in den Dateityp "Bioinformatik-Trace-Datei" umzuwandeln, benötigen Sie Sequence Scanner oder ein ähnliches Tool.
Eine .AB1-Datei ist eine DNA-Sequenzierungs-Chromatogramm-Datei, die von Sanger-Sequenziergeräten erstellt wird, hauptsächlich von solchen, die von Applied Biosystems hergestellt werden. Sie enthält sowohl die rohen Fluoreszenzintensitätsdaten (Elektropherogramm-Spur) als auch die resultierenden Base-Calls aus einem Sequenzierlauf. Typischerweise werden diese Dateien mit speziellen Bioinformatik-Tools wie SnapGene oder Chromas betrachtet.
Das .AB1-Format ist jedoch proprietär und stark binär. Seine interne Struktur ist bekanntermaßen unzusammenhängend und hat sich über Jahrzehnte hinweg planlos entwickelt, wobei neue Felder einfach hinzugefügt wurden, wenn neue Sequenziermodelle auf den Markt kamen. Du kannst es nicht nativ in einem Standard-Texteditor öffnen, um die genetische Sequenz anzuzeigen, was es frustrierend macht, es mit Kollegen zu teilen oder in grundlegende Alignment-Pipelines einzugeben.
Um die DNA-Sequenzdaten tatsächlich für nachgelagerte Analysen nutzen zu können, ist eine Konvertierung erforderlich. Das Extrahieren der Sequenz in eine FASTA- oder FASTQ-Datei wandelt die rohen Binärdaten in universell akzeptierte textbasierte Formate für BLAST-Suchen oder Sequenz-Assemblierungen um. Wenn du die visuellen Peak-Spuren mit nicht-technischen Stakeholdern teilen musst, erstellt die Konvertierung in PDF einen statischen grafischen Schnappschuss. Ziehe deine Datei hierher, um sie sicher direkt in deinem Browser anzuzeigen und zu konvertieren.
Convert.Guru analysiert Ihre AB1-Datei, erkennt das genaue Format und ermöglicht es Ihnen, den enthaltenen Text auszulesen.
Nutzer konvertierten auch ABI, AB, FSTA, SEQ, FASTA, ZIP, FAS, SCF, PDF, TXT, RAR, GB und DOCX-Dateien.
Wenn Sie eine AB1-Datei in FASTA, PDF, CSV, JSON, XML, YAML, YML, TOML, INI, CFG, CONF oder DAT umwandeln möchten, können Sie Sequence Scanner oder eine ähnliche Software aus der Kategorie „Speicherung von DNA-Sequenzierungs-Chromatogrammen“ verwenden. Suchen Sie im Menü „Datei“ nach Speichern unter… oder Exportieren….
Um DBF, XML, SQLITE, XLSX, SQL, TSV, ACCDB, YAML, MDB, CSV, ODS oder JSON-Dateien in AB1 umzuwandeln, versuchen Sie es mit Sequence Scanner oder einem vergleichbaren Tool aus der Kategorie „Speicherung von DNA-Sequenzierungs-Chromatogrammen“.
Convert.Guru basiert auf einer der größten und renommiertesten Dateiformat-Datenbanken, die seit über 25 Jahren gepflegt wird. Unsere Formaterkennung identifiziert AB1 zuverlässig – auch bei falsch benannten oder beschädigten Dateien – und wandelt sie in gängige Formate um. Direkt im Browser, ohne Registrierung oder Installation. Hochgeladene Dateien werden nach der Konvertierung automatisch gelöscht. Entwickelt wird der AB1 Konverter in Deutschland.