MOL2コンバーターについて
Convert.Guru は、25年以上にわたり維持・更新されてきた、世界最大級かつ信頼性の高いファイル形式データベースの一つを基盤としています。 当社の形式判定機能は、MOL2 を高い精度で識別します。ファイル名が誤っている場合や破損している場合でも対応し、一般的な形式へ変換できます。MOL2 コンバーターは登録やインストール不要で、ブラウザ上でそのまま利用できます。 アップロードされたファイルは、変換後に自動的に削除されます。
MOL2 コンバーター
分子構造ファイル (MOL2) からテキストを抽出
MOL2 ファイルからテキストを抽出する方法
- 上記の "ファイルを選択" ボタンをクリックし、MOL2 ファイルを選択します。
- 利用可能な場合は、プレビューが表示されます。
- "ファイルを変換..." ボタンをクリックして、テキスト情報を抽出します。
MOL2 ファイルについて
.MOL2ファイルは、Triposが同社のSYBYL分子モデリングソフトウェア用に作成した構造化プレーンテキストフォーマットだ。原子座標、結合、部分構造、部分電荷などの包括的な3D分子データを保存する。計算化学、創薬、分子ドッキングにおいて、研究者に広く利用されている。これらのファイルは、BIOVIA Discovery Studio、Avogadro、PyMOLなどの専門的な科学ソフトウェアで開くことができる。
詳細なデータを持つ一方で、.MOL2フォーマットには現実的な課題もいくつかある。これはレガシーな独自フォーマットであり、多くの最新のWebアプリケーションや一般的な3Dビューアでは読み込むことができない。表示や分析には、通常、専門的で高価なデスクトップソフトウェアが必要になる。さらに、このフォーマットは厳密な列のスペースに依存しているため、わずかなフォーマットエラーやカスタム原子タイプがあるだけで、厳格なパーサーは完全に失敗してしまう可能性がある。
異なるプラットフォーム間で分子データを共有したり、オープンソースのバイオインフォマティクスツールで使用したりするには、変換が必要だ。構造生物学ツールとの幅広い互換性を持たせるには、.PDB（Protein Data Bank）に変換しよう。2D/3D化学データベースへの取り込みや標準的な描画ツール用には、.SDFまたは.MOLに変換する。量子化学ソフトウェアでのシンプルな座標マッピングには、.XYZへの変換が適している。ここに.MOL2ファイルをドラッグ＆ドロップすれば、ブラウザ上で安全に分析・変換できる。無料でオンラインで利用でき、複雑なモデリングソフトウェアをインストールする必要もない。
Convert.Guru はMOL2ファイルを分析し、正確な形式を検出して、中のテキストを読めるようにします。
ほかのユーザーは MOL, PDB, SDF, PNG, JSON, XLSX, XML, JPG, GZ, KSS, STR ファイルも変換しました。
よくある質問
MOL2 ファイルを PDB, STR, CSV, JSON, XML, YAML, YML, TOML, INI, CFG, CONF または DAT に変換したい場合は、SYBYL または「分子構造の保存」カテゴリの同様のソフトウェアを使用できます。[ファイル] メニューで 名前を付けて保存… または エクスポート… を探してください。
DBF, XML, SQLITE, XLSX, SQL, TSV, ACCDB, YAML, MDB, CSV, ODS または JSON ファイルを MOL2 に変換するには、SYBYL または「分子構造の保存」カテゴリの他の同等のツールを試してください。