FQコンバーターについて
Convert.Guru は、25年以上にわたり維持・更新されてきた、世界最大級かつ信頼性の高いファイル形式データベースの一つを基盤としています。 当社の形式判定機能は、FQ を高い精度で識別します。ファイル名が誤っている場合や破損している場合でも対応し、一般的な形式へ変換できます。FQ コンバーターは登録やインストール不要で、ブラウザ上でそのまま利用できます。 アップロードされたファイルは、変換後に自動的に削除されます。
FQ コンバーター
生のシーケンスファイル (FQ) からテキストを抽出
FQ ファイルからテキストを抽出する方法
- 上記の "ファイルを選択" ボタンをクリックし、FQ ファイルを選択します。
- 利用可能な場合は、プレビューが表示されます。
- "ファイルを変換..." ボタンをクリックして、テキスト情報を抽出します。
FQ ファイルについて
.fqファイル拡張子は、FASTQ formatのテキストファイルです。生の生物学的配列データ（特に塩基配列）と、各塩基対に対応するPhred品質スコアを保存します。これらのファイルは、次世代DNAシーケンシングプラットフォーム（特にIlluminaが開発したもの）からの標準的な出力です。
プレーンテキストであるにもかかわらず、.fqファイルの取り扱いは非常に困難です。1回のシーケンシングで100GBを超えるファイルが生成されることもあります。メモ帳やWordなどの標準的なテキストエディタで.fqファイルを開こうとすると、コンピュータが即座にフリーズしたりクラッシュしたりします。これらは高価なストレージを大量に消費し、手動で変更したり破損したりすると解析ツールが機能しなくなる厳密な4行ブロック構造に依存しています。
このデータを管理しやすくするには、変換または圧縮が必須です。アーカイブや転送の場合は、.fqを.gz（gzip）に変換して圧縮し、ファイルサイズを最大80%削減します。生の配列文字列のみが必要で、重い品質スコアを破棄したい場合は、.fqを.fastaまたは.faに変換します。カスタムスクリプトやデータベースへの取り込みには、.csvや.tsvなどの表形式が適しています。ファイルをここにドラッグ＆ドロップするだけで、重いバイオインフォマティクスパイプラインをインストールすることなく、オンラインで無料で解析・変換できます。
Convert.Guru はFQファイルを分析し、正確な形式を検出して、中のテキストを読めるようにします。
ほかのユーザーは FASTQ, GZ, FA, FSA_NT, FSTA, FASTA ファイルも変換しました。
よくある質問
FQ ファイルを FASTA に変換したい場合は、FastQC または「生物学的配列データの保存」カテゴリの同様のソフトウェアを使用できます。[ファイル] メニューで 名前を付けて保存… または エクスポート… を探してください。
ファイルを FQ に変換するには、FastQC または「生物学的配列データの保存」カテゴリの他の同等のツールを試してください。