FLATコンバーターについて
Convert.Guru は、25年以上にわたり維持・更新されてきた、世界最大級かつ信頼性の高いファイル形式データベースの一つを基盤としています。 当社の形式判定機能は、FLAT を高い精度で識別します。ファイル名が誤っている場合や破損している場合でも対応し、一般的な形式へ変換できます。FLAT コンバーターは登録やインストール不要で、ブラウザ上でそのまま利用できます。 アップロードされたファイルは、変換後に自動的に削除されます。
FLAT コンバーター
GenBank 配列ファイル (FLAT) からテキストを抽出
FLAT ファイルからテキストを抽出する方法
- 上記の "ファイルを選択" ボタンをクリックし、FLAT ファイルを選択します。
- 利用可能な場合は、プレビューが表示されます。
- "ファイルを変換..." ボタンをクリックして、テキスト情報を抽出します。
FLAT ファイルについて
.flatファイルは、主にDNA、RNA、タンパク質などの生物学的配列データを詳細なテキストベースのアノテーションとともに保存するために使用されるGenBank配列フラットファイルです。これらのファイルは通常、NCBIデータベースから取得されるか、同データベースに提出されます。研究者は、NCBI BLASTやSnapGeneなどのバイオインフォマティクスソフトウェア、またはBioPythonなどのプログラミングライブラリを使用してこれらのファイルを開き、遺伝子構造やフィーチャーマップを分析します。
GenBankフラットフォーマットの主な欠点は、その冗長性にあります。文献参照、フィーチャーの位置、生物の分類、翻訳キーなどの膨大なメタデータが含まれているため、生の配列だけが必要な場合にはファイルが不必要に大きくなります。さらに、このフォーマットはバイオインフォマティクスに特化しています。標準的なテキストエディタでは、数ギガバイトに及ぶ.flatゲノムデータベースを処理しようとすると、フリーズしたりクラッシュしたりすることがよくあります。
アライメントツールに必要な生の配列データを分離するために、ユーザーは頻繁に.flatファイルを.FASTAフォーマットに変換する必要があります。あるいは、.GFF（General Feature Format）に変換することで、アノテーションを機械可読な表構造に分離できます。標準的なオンラインコンバーターはゲノムの構文を理解していないため、これらの生物学的構造を正確に解析できません。ファイルをドラッグ＆ドロップするだけで、フォーマットを識別し、表示し、可能な場合は変換できます。.flatファイルは基本的にプレーンテキストであるため、convert.guruはファイルを検査し、生の配列文字列を抽出し、専用のゲノムソフトウェアがなくても読み取り可能なデータを提示することができます。
Convert.Guru はFLATファイルを分析し、正確な形式を検出して、中のテキストを読めるようにします。
ほかのユーザーは PDF ファイルも変換しました。
よくある質問
FLAT ファイルを に変換したい場合は、NCBI BLAST または「生物学的配列の保存」カテゴリの同様のソフトウェアを使用できます。[ファイル] メニューで 名前を付けて保存… または エクスポート… を探してください。
ファイルを FLAT に変換するには、NCBI BLAST または「生物学的配列の保存」カテゴリの他の同等のツールを試してください。